MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Colwellia psychrerythraea 34H chromosome

Total Repeats: 18995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003910	ATA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003910	ATA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003910	TAC	2	6	55	60	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_003910	TAAAAA	2	12	1462	1473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003910	TAT	2	6	2605	2610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003910	T	8	8	2623	2630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003910	TAAA	2	8	6237	6244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003910	TAAT	2	8	6301	6308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003910	A	6	6	9402	9407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003910	AAATA	2	10	9413	9422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003910	T	7	7	9445	9451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003910	AAAT	2	8	9470	9477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003910	TAA	2	6	9479	9484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003910	CAA	3	9	9510	9518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003910	AGGCA	2	10	9606	9615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003910	TTGA	2	8	9616	9623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003910	TTC	2	6	9711	9716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003910	CCT	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_003910	T	6	6	9726	9731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003910	TAA	2	6	9746	9751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003910	AC	3	6	9792	9797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003910	TA	4	8	9816	9823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003910	TTCAA	2	10	10504	10513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003910	TGA	2	6	10521	10526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003910	TGAAG	2	10	10561	10570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003910	CTT	2	6	10582	10587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003910	AAT	2	6	10620	10625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003910	ATT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003910	TGCCT	2	10	10657	10666	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_003910	TAAA	2	8	10769	10776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003910	CAATA	2	10	11531	11540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003910	TTAC	2	8	11566	11573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003910	AAT	2	6	11854	11859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003910	A	7	7	11888	11894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003910	TTA	2	6	11953	11958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003910	TTG	2	6	15472	15477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003910	TGAA	2	8	15507	15514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003910	TA	3	6	17698	17703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003910	TA	3	6	17714	17719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003910	TCA	2	6	17733	17738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003910	AATT	2	8	20742	20749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003910	TCTACA	2	12	20766	20777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_003910	CTTGAA	2	12	20829	20840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003910	ATA	2	6	20909	20914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003910	TAT	2	6	20922	20927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003910	CAA	2	6	20930	20935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_003910	ATT	2	6	20940	20945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003910	AGG	2	6	20996	21001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003910	TTA	2	6	21020	21025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003910	CT	3	6	21034	21039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003910	TAT	2	6	24789	24794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003910	GTAA	3	12	24796	24807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003910	TTA	2	6	25331	25336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003910	TAAT	2	8	25350	25357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003910	ATGTT	2	10	25363	25372	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003910	TA	3	6	25378	25383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003910	GTAACT	2	12	25389	25400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_003910	TAA	2	6	25433	25438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003910	CAG	2	6	25452	25457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_003910	CCT	2	6	26595	26600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_003910	TA	3	6	27805	27810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003910	CAG	2	6	28336	28341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003910	T	6	6	28365	28370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003910	ATA	2	6	28376	28381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003910	A	7	7	28999	29005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003910	T	6	6	29022	29027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003910	A	7	7	30718	30724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003910	TTC	2	6	30732	30737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003910	AT	3	6	30738	30743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003910	GAA	2	6	30744	30749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003910	CAT	2	6	30826	30831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003910	CGC	2	6	31484	31489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_003910	TTA	2	6	31614	31619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003910	ATT	2	6	31645	31650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003910	AT	3	6	31657	31662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003910	CAA	2	6	32395	32400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_003910	T	6	6	32438	32443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003910	AG	3	6	33332	33337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003910	TGC	2	6	34132	34137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_003910	AGT	2	6	34155	34160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003910	TAGC	2	8	34174	34181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003910	TAA	2	6	34182	34187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003910	A	6	6	34215	34220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003910	ATT	2	6	34254	34259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003910	A	6	6	34350	34355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003910	ATC	2	6	34420	34425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_003910	TAAC	2	8	34465	34472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_003910	ATG	2	6	34483	34488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003910	ATT	2	6	34506	34511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003910	TAT	2	6	34545	34550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003910	CTT	2	6	34631	34636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_003910	TTC	2	6	34653	34658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_003910	TG	3	6	34684	34689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003910	TGT	2	6	34703	34708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003910	TAGG	2	8	34733	34740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003910	A	6	6	34744	34749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003910	AATG	2	8	34755	34762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003910	AAAT	2	8	34773	34780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003910	TTAT	2	8	34785	34792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003910	GGC	2	6	34945	34950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003910	CTG	2	6	34997	35002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003910	GCG	2	6	35007	35012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_003910	TGG	2	6	35045	35050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003910	ACA	2	6	35054	35059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003910	G	7	7	35103	35109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003910	TTC	2	6	35111	35116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003910	CGA	2	6	35184	35189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_003910	GAT	2	6	35209	35214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003910	GCA	2	6	35258	35263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_003910	GT	3	6	35311	35316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003910	GAA	2	6	35317	35322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003910	AAC	2	6	35394	35399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_003910	AGA	2	6	35400	35405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003910	CAG	2	6	35426	35431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_003910	GTG	2	6	35575	35580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003910	GGAA	2	8	35616	35623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003910	GGC	2	6	35637	35642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_003910	GAA	2	6	35880	35885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003910	AGAGA	2	10	35907	35916	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003910	TGC	2	6	35956	35961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003910	GTC	2	6	35968	35973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003910	GGA	2	6	36082	36087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003910	GAC	2	6	36095	36100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003910	TCA	2	6	36107	36112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_003910	AC	3	6	36133	36138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_003910	GCA	2	6	36163	36168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003910	AC	3	6	36302	36307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_003910	AAG	2	6	36338	36343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003910	GGA	2	6	36364	36369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003910	CAC	2	6	36374	36379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_003910	CCT	2	6	36445	36450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_003910	CA	3	6	36510	36515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_003910	AGA	2	6	36535	36540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003910	TTC	2	6	36651	36656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_003910	AAAG	2	8	36660	36667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003910	T	6	6	36711	36716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003910	TGAA	2	8	36867	36874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003910	C	6	6	36893	36898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_003910	TAT	2	6	36906	36911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003910	ATG	2	6	36936	36941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003910	ACT	2	6	37060	37065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_003910	TGG	2	6	37098	37103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003910	GGTGA	2	10	37156	37165	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003910	AGGT	2	8	37217	37224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003910	TAG	2	6	37316	37321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003910	GCGA	2	8	37324	37331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_003910	TAG	2	6	37363	37368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_003910	CGG	2	6	48372	48377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_003910	TGG	2	6	48622	48627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_003910	ACC	2	6	48643	48648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_003910	TGG	2	6	48703	48708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_003910	ACTTTA	2	12	57674	57685	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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442	NC_003910	GAAA	3	12	63595	63606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_003910	ATT	2	6	78785	78790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_003910	GA	3	6	83980	83985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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